Биоинформатика: Анализ существующих баз данных - настоящее и будущее - BioinforMatix.ru - портал по биоинформатике, имейджингу и биософту

Биоинформатика: Анализ существующих баз данных - настоящее и будущее

Печать E-mail
Автор Арчаков   А .И.   
21.10.2008 г.
Необходимо подчеркнуть, что в отличие от традиционной библиографической научно-технической информации, собираемой и распространяемой на печатных носителях и в электронной форме такими информационными службами как National Library of Medicine (US), Chemical Abstracts Service (US), BIOSIS (US), Excerpta Medica (The Netherlands), ВИНИТИ (Россия), МЦНТИ (Россия) и др., данные по биоинформатике являются фактографическими и гораздо более тесно привязаны к источникам их происхождения.
 
<a href='http://www.bioinformatix.ru/bioinformatika/' target='_self'>Биоинформатика</a>: Базы данныхПо этой причине все известные в настоящее время базы данных по биоинформатике созданы и поддерживаются либо специально созданными для этой цели организациями, например European Molecular Biology Laboratory (Germany), European Bioinformatics Institute (UK), GenBank (US), National Center for Biotechnology Information (US), DNA DataBank of Japan (Japan) и др., либо функционируют на базе известных научно-исследовательских учреждений, ведущих экспериментальные работы в области биохимии и молекулярной биологии, например, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, NIH (USA); Institute of Pharmaceutical Chemistry, University of Marburg (Germany); Department of Biochemistry, Kumamoto University School of Medicine (Japan); Институт цитологии и генетики СО РАН (Новосибирск), Институт биомедицинской химии РАМН (Москва), Институт физико-химической биологии МГУ им.  А .Н.Белозерского и др. Как правило, в первом случае обеспечивается функционирование общих банков данных (БД) по биоинформатике, содержащих информацию о самых разных последовательностях белков и нуклеиновых кислот (GenBank, SWISS-PROT, и др.),  а  во втором – специализированных банков данных (БД по кодирующим ДНК цитокинов, БД по лиганд-рецепторным взаимодействиям, БД по цитохромам Р450, и т.д.).

Поскольку информация по биоинформатике весьма разнообразна и многоаспектна, такое "разделение труда" представляется целесообразным, поскольку благодаря этому обеспечивается наиболее высокий уровень экспертной оценки данных. Вместе с тем, в настоящее время остро стоит проблема интеграции информации (Karp, 1996), содержащейся в различных банках данных, которая успешно решается как путем стандартизации представления информации, так и благодаря созданию необходимых конверторов. Пример системы обработки информации из различных фактографических и библиографических банков данных, созданной в EMBL.

Разработанная в EMBL компьютерная система обеспечивает работу с информацией из примерно 50 общих и специализированных банков данных, доступных через Интернет.

По-видимому, в будущем сохранится тенденция, когда наряду со сравнительно небольшим количеством глобальных (общих) банков данных, содержащих ограниченный объем информации по большому числу аминокислотным и нуклеотидным последовательностям, будет расти число специализированных банков данных, содержащих большой объем разнообразной информации по отдельным категориям аминокислотных и нуклеотидных последовательностей, относящимся к узкой предметной области.

В то же время, будут интенсивно развиваться и поисковые системы, собирающие и интегрирующие информацию в соответствии с конкретными запросами пользователей из многочисленных (общих и специализированных) банков данных

 

Читайте  также:

Биоинформатика: Возможности будущего сотрудничества с СНГ
Последнее обновление ( 03.04.2009 г. )
 
« Пред.   След. »