|
Становление биоинформатики как научной дисциплины произошло около 10 лет назад.В перечне пециальностей Высшей Аттестационной Комиссии (ВАК) «биоинформатика» появилась только в 2005 году. Одновременно с появлением специальности критическая технология «Биоинформационные технологии» была включена в список приоритетных направлений развития науки и техники на 2005-06 гг. согласно определению ВАК, биоинформатика – «научная специальность, занимающаяся изучением организации и функционирования биологических систем разного уровня (от молекулярного до популяционного) на основе методов и средств информатики». В формуле оговаривается, что «специальность не включает математическое моделирование механизмов деятельности конкретных биологических систем».
Эта формулировка исключает из рассмотрения проекты, относящиеся к вопросам медицинской информатики, биофизики и биохимии, бионики и анализа эргатических систем и т.п. Биоинформатика естественным образом объединяет два аспекта, и это отражено как формуле специальности ВАК, так и в определении, данном специалистами Европейского Биоинформационного Института (EBI): биоинформатика – это применение компьютерных технологий для администрирования и анализа биологических данных. Таким образом, с одной стороны, специфика биологических данных – геномов, транскриптомов, протеомов, метаболомов, структур макромолекул и их комплексов – подразумевает необходимость разработки адекватных подходов к хранению, доступу и аннотированию информации, т.е. необходимость администрирования. С другой стороны, необходимы специальные средства для обработки этих данных с целью выявления сложных закономерностей.
Вопросы, связанные с администрированием данных, составляют сущность биоинформационных технологий. В рамках биоинформационных технологий не делается акцент на разработку новых алгоритмов, так это происходит в рамках биоинформатики. Наоборот, область биоинформационных технологий подразумевают осознанный отказ от новых, пусть даже и продуктивных фундаментальных идей, и сосредоточение усилий на практическом внедрении уже созданных ранее подходов к изучению живых систем.
С этой точки зрения, на смену биоинформационным ключевым словам – молекулярное моделирование, анализ геномов и т.п. – приходят термины из теории управления и автоматизации, методы распознавания образов, методики разработки СУБД и т.п.
Суть принципиальных проблем, с которыми столкнулась секция «Биоинформационные технологии» в процессе подготовки материалов к рассмотрению на Научно-координационных советах Минобрнауки заключалась в следующем. Инициативные научные коллективы России в содержании своих заявок игнорировали смысловое наполнение специальности, считая подпадающими под критическую технологию любые исследования, включающие живой объект и компьютерную систему. В результате более 50% всех проектов, рассмотренных в ходе заседаний секции, вообще не отвечали современному пониманию задач биоинформационных технологий и формальному определению ВАК.
Как и любую технологию, биоинформационные подходы нельзя рассматривать в отрыве от конечной цели. В глобальном масштабе интерес представляют две цели: создание новых биологически активных веществ и разработка новых способов медицинской диагностики. Только в связи с изысканиями в указанных областях можно ожидать результатов, позволяющих осуществить перевод российской науки на инновационный путь развития. В плане достижения указанных целей необходимо эффективно решить принципиальную задачу интеграции. На успешное ее решение и были направлены критерии отбора конкурсных тематик.
В представляемом докладе будут рассмотрена общие принципы построения архитектуры интегральной вычислительной платформы «от геномов к лекарству» и будет показано, как архитектурные концепции нашли свое отражение в формулировках тем, предложенных секцией «Биоинформационные технологии».
А.И.Арчаков, А.В.Лисица
Государственное Учреждение Научно-исследовательский институт биомедицинской
химии им. В.Н. Ореховича Российской академии медицинских наук, Москва
Тел.: (095) 246-69-80, e-mail:
Этот e-mail защищен от спам-ботов. Для его просмотра в вашем браузере должна быть включена поддержка Java-script
Читайте также:
|
