1) “Классический” путь создания лекарств

(I) Поиск биологически активных соединений ®

(II) Фармакологические испытания ®

(III) Клинические испытания ®

2) Общие положения:

            - Компьютерное конструирование лекарств (Computer-Aided Drug Design - CADD)
            - Рациональное конструировании лекарств (rational drug design).

3) Догма молекулярной фармакологии

            Лекарство (лиганд) ®

            Макромолекула-мишень (“Рецептор”) ®

4) Конструирование лекарств на основе структуры макромолекулы-мишени

            Макромолекула-мишень ® Структура (3D) ® Место связывания лиганда ®

            ® Поиск или конструирование структур-прототипов ® Прототип нового лекарства ®

            ® “Классический” путь

5) Предположения и ограничения: (похожие соединения связываются похожим образом; лиганд и “рецептор” взаимодействуют в одной конформации; среда (растворитель, ионы и примеси) играют малую роль; данные экспериментов точные; связывание лекарства обратимо и не ковалентно; имеется достаточно информации; методы CADD предлагают гипотезы).

6) Триада XXI века

            ГЕНОМИКА ®

            ПРОТЕОМИКА ®

            БИОИНФОРМАТИКА ®

7) Анализ генома

Геном ®

“Разметка” генома ®

Функциональная классификация генов ®

Выбор генов-мишеней для действия лекарств ®

8) Новые вычислительные методы определения функции белков и их взаимодействия друг с другом путем анализа геномных последовательностей

9) Сравнительная геномика

10) Анализ места связывания лиганда в структуре белка-мишени

11) Непрямой путь:

набор известных лигандов +  активность лигандов ®

3D QSAR, CoMFA, Pharmacophore ®

место связывания лиганда ®

12) Поиск новых лигандов в базах данных

13) Пример - Agouron Pharmaceuticals (США) 1999 г. HIV protease inhibitors (peptidomimetics)

14) Стратегия компьютерного конструирования лекарств

15) Информация о спецкурсе для студентов 6-го курса МБФ РГМУ "Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств"

Вопросы:

1.      В чем состоит основная «догма молекулярной фармакологии»?

2.    Для чего может быть использована информация, полученная в рамках проекта «геном человека», при создании новых лекарств?

3.      Как используются компьютерные технологии для поиска прототипа нового лекарства?

4.      В состоит основная задача сравнительной геномики при решении задач создания новых лекарств?

Иванов А.С., проф., д.б.н. ( Этот e-mail защищен от спам-ботов. Для его просмотра в вашем браузере должна быть включена поддержка Java-script )