Лекция. Генетическое картирование болезней человека. Геномная медицина - BioinforMatix.ru - портал по биоинформатике, имейджингу и биософту

Лекция. Генетическое картирование болезней человека. Геномная медицина

Печать E-mail
Автор Степанов В.  А .   
23.05.2009 г.

План лекции

Стратегии картирования генов болезней
Мультифакторные болезни и проблемы их картирования
Методы генетического картировния болзней
 - анализ сцепления
 - метод идентичных по происхождению аллелей
 - анализ ассоциаций
 - экспериментальные скрещивания модельных объектов
Геномная медицина

Значение генетики для медицины

3500 нозологических форм наследственных болезней, поражающих все органы, системы и функции организма

Распространенность НП у детей: 5-5,5% новорожденных
            Генные болезни - 1%
            Хромосомные болезни - 0,5%
            Болезни с наслественной предрасположенностью - 3-3,5%
            Несовместимость матери и плода - 0,4%
            Генетические соматические нарушения - ?

Причины детской смертности: до 50%  в пери- и неонатальной смертности - ВПР, НБ и другие «генетические» причины
            Генные болезни - 8-10%
            Хромосомные - 2-3%
            Мультифакториальные (генетич. предрасположенность) - 35-40%
            Негенетические причины - 50%

Смена «профиля» НП с возрастом при постоянстве «груза»
           
Генетические аспекты классификации болезней

1. Болезни, вызванные мутацией отдельного гена (генные, менделевские)
2. Болезни, обусловленные хромосомными нарушениями (синдромы, ВПР)
3. Болезни с наследственной предрасположенностью - мультифакториальные заболевания как результат взаимодействия генетических и средовых факторов
4. Болезни с нетрадиционным типом наследования (митохондриальные болезни, болезни геномного импринтинга, болезни экспансии тринуклеотидных повторов, прионные болезни)
5. Генетические болезни соматических клеток (новообразование, старение)

Функциональное картирование - наличие априорных знаний о точной природе дефекта (биохимия, физиология): серповидно-клеточная анемия, фенилкетонурия…
Кандидатное картирование - круг возможных кандидатных генов
Клонирование предшествует картированию. Путь от функции к позиции
«Обратная» генетика (Ботстейн, 1980). От карты (позиции) - к функции. Картирование - клонирование
Позиционное картирование
Позиционо-кандидатное картрование
Детальная карта генома. Базы данных по известным генам и потенциальным генам.
Базы данных по экспрессируемым последовательностям (EST)

Проблемы, затрудняющие генетическое картирование МФЗ

Нет однозначного соответствия генотип-фенотип

Один генотип - разные фенотипы, разные генотипы - один фенотип

Полигения / мультифакториальность
Фенотип является результатом действия аллелей нескольких (многих) генетических локусов / в сочетании с действием средовых факторов
Неполная пенетрантность
Не все носители мутантного генотипа проявляют фенотип, отличный от нормы
Фенокопии
Проявление мутантного  фенотипа у индивидов с нормальным генотипом по причинам негенетического характера
Генетическая гетерогенность
Сходство клинической картины для мутаций по различным генетическим локусам
Неменделевские механизмы передачи генетической информации
Митохондриальная наследственность
Импринтинг
Антисипация (экспансия тринуклеотидных повторов)
Высокая частота аллеля связанного с болезнью
                Присутствие в родословной нескольких копий аллеля различных
                по происхождению
Редкость заболевания
                Затруднен сбор родословных с несколькими больными
                индивидами  

Скачать эту лекцию целиком (580 кб)

Скачать весь курс лекций (23,2 мб) Курс лекций (10 лекций) "Геномика и геномная медицина" (автор - Степанов Вадим Анатольевич, д.б.н., профессор кафедры медицинской генетики СибГМУ, зам. директора НИИ медицинской генетики ТНЦ СО РАМН)

 
« Пред.   След. »