|
Новая,
более простая и дешевая методика секвенирования ДНК была использована
для расшифровки и анализа митохондриального генома пятерых
неандертальцев.
Исследователи отмечают, что новая методика позволяет обойти
трудности, возникающие при анализе частично разрушенной древней ДНК,
что позволяет лучше понять генетические черты и особенность эволюции
неандертальцев и других древних видов.
В прошлом году группа под руководством Сванте Паабо (Svante Pääbo)
из Института Эволюционной Антропологии Макса Планка (Лейпциг) проделала
первый полный анализ митохондриальной ДНК неандертальца с помощью
секвенирования методом «выстрела из дробовика» (shotgun sequencing –
метод определения первичной нуклеотидной последовательности с
использованием крупных стохастических фрагментов с перекрывающимися
последовательностями). Тем не менее, эта методика требует больших
затрат времени, в ней расходуются большие количества драгоценной
древней ДНК, при реализации этой методики происходит секвенирование
всех нуклеиновых кислот образца, при этом 99% всех нуклеиновых кислот,
извлекаемых их древних окаменелостей обычно принадлежит бактериям и
грибкам, внедрившимся в костную ткань останков.
Для того чтобы избежать трудностей, описанных выше, Паабо с
коллегами разработал ускоренный, дешевый и дающий меньшее количество
отходов метод реконструирования геномов древних биологических видов –
метод улавливания расширения праймера [primer extension capture (PEC)].
Еще одна причина заключалась и в том, что предоставленные для изучения
новые образцы оказались в плохо сохранившемся состоянии, и их анализ
методом «выстрела из дробовика» мог бы стоить миллионы долларов.
|
