Этот модуль открывает новое окно приложения. В левой части окна - типы изучаемых
объектов и соответствующие счетчики. В правой части - активные кнопки.
Функции
кнопок:
Initialize: Инициализирует текущее изображение или стек для подсчета. Команда создает дубликат изображения или стека с
названием «counter window» и оставляет открытым
оригинальное изображение если отмечено «keep original».
Add: Добавляет новый тип объекта к счетчикам
Remove: Удаляет последний тип из списка счетчиков
Delete mode: Режим удаления:
переключает между режимом вставки и удаления метки. Когда отмечено
– метки выбранного типа будут удаляться при выборе курсором мышки.
Delete: Удаляет последнюю установленную метку.
Reset: устанавливает все счетчики в нулевое значение и
убирает метки с изображения.
Results: Показывает результаты работы счетчика в таблице результатов
ImageJ. При
работе со стеком производится расчет на каждый слой и отображается
итоговый результат.
Save Markers: Экспортирует данные о маркерах в XML-файл.
Load Markers: Загружает данные о маркерах, сохраненных в XML-файле.
Export Image: Создает копию окна изображения с метками,
нанесенными на него. В случае со стеком только текущий слой копируется в
новое изображение.
Measure...: Измеряет значение пикселей у каждого маркера и
показывает его в окне результатов в виде: Тип – Слой – Х-кордината – Y-координата – Значение пикселя.
Использование:
Открыть модуль «Cell Counter» и
изображение/стек, которое необходимо обсчитать. Нажать кнопку «initialize», после чего можно начинать подсчет объектов
(клеток) на изображении, выбирая нужные типы.
Каждый тип на изображении отмечается индивидуальным цветом при выборе
мышкой. В любой момент можно добавить или сократить количество типов изучаемых
объектов.
