Представленный метод также можно использовать для преклинических испытаний лекарственных средств, он позволяет на ранней стадии обнаруживать возможные побочные эффекты новых препаратов.
Метаболомика направлена на изучение совокупности всех молекул клетки или ткани. Ученые-биоинформатики проанализировали данные, собранные в ходе исследования , проведенного на здоровых и больных диабетом мышах. В каждом случае, животным давали лекарство против диабета – Розиглитазон (RoziglitazoneTM). После этого у 40 мышей в плазме крови было выделено более 800 метаболитов, представляющих факторы «здоров/болен диабетом» и «лекарства принимались/лекарства не принимались». Карстен Сур (Karsten Suhre), руководитель исследования в Центре Гельмгольца, объясняет эти результаты так: «Оказалось, что во многих случаях соотношение между концентрацией определенных метаболитов было более информативно, чем их количественная концентрация». При помощи последующей кластеризации статистических данных о парах метаболитов стало возможным определить группы метаболитов, которые разделяют животных по факторам «здоров/болен» и «лекарство принималось/не принималось».
Результаты показали, что биомаркеры диабета можно определить посредством объективного биоинформатического анализа комплексных метаболомических данных, полученных при помощи экспериментов. Сур добавил: «Такой подход можно использовать в совокупности с новой метаболомической платформой (metaP) Центра Гельмгольца для автоматической идентификации групп существенных биомаркеров болезни. К тому же, используя преклинические исследования эффектов новых лекарств, при помощи метаболомики можно на ранней стадии обнаруживать возможные побочные эффекты, оказываемые препаратом на обмен веществ».
До сих пор генетические методы и транскрипционный анализ оставались лучшими инструментами в исследовании болезней обмена веществ. Теперь, прогресс в области массовой спектроскопии позволяет проводить экстенсивное изучение метаболом. Карстен Сур добавил: «Благодаря скачку в области анализа метаболитов, задачей биоинформатики становится развитие особых численных методов, которые помогут справиться со сложными наборами данных, содержащими огромное количество информации».
