Программа Gromacs 4.0 - финальная официальная Программа Gromacs 4.0 - финальная официальная версия - BioinforMatix.ru - портал по биоинформатике, имейджингу и биософту
Программа Gromacs 4.0 - финальная официальная Программа Gromacs 4.0 - финальная официальная версия |
|
|
| Автор Энглевский Николай | |
| 27.05.2009 г . | |
|
Основные изменения по сравнению с предыдущими версиями
• Наследственное разложение обеспечивается по двум величинам, что обеспечивает наилучший масштаб. Параллельно могут быть запущены 2 процесса (grompp и mpirun -np mdrun) – на выбор. • Для наиболее быстрого сравнения отклонений оно тоже происходит в параллельном режиме. • Восстановление работы программы в случае внезапного обрыва. • Поддержка табулирования взаимодействий, особенно необходимого для крупнозернистого сравнения. • Поддержка дружественного обновления • Несколько новых PME и некоторых опций электростатического взаимодействия. • Улучшенное сохранение энергии для всех применяемых алгоритмах. • Выполнение нескольких задач могут идти параллельно • Несколько новых инструментов и сервисов для анализирования Инсталляция программы GROMACS
Программа GROMACS очень мощная, и для ее установки требуется неслабые ресурсы компьютера. При слабой конфигурации компьютера, при выполнении некоторых заданий в программе GROMACS возможно некоторое замедление работы компьютера.
Для установления программы GROMACS на ваш компьютер, вы должны обладать правами администратора. При возникновении каких-либо вопросов вы можете связаться с разработчиками программы по e-mail и получить подробную инструкцию. Начиная с версии 3.0, программа GROMACS использует автоматический скрипт установки, что делает установку очень простой. Для установки программы GROMACS вам потребуется 100 мб оперативной памяти, и чуть более 10 мб пространства на жестком диске. В процессе работы программы (особенно при процессе построения моделей) может произойти замедление в работе компьютера. Для устранения этой проблемы разработчики рекомендуют использовать 200 мб оперативной памяти и более. Перед установкой программы GROMACS, закройте все работающие программы на вашем компьютере.
Перевод с английского Энглевский Николай
|
| « Пред. | След. » |
|---|