И снова функциональная геномика - BioinforMatix.ru - портал по биоинформатике, имейджингу и биософту
И снова функциональная геномика |
|
|
| Автор Неизвестен | |
| 09.10.2008 г. | |
|
Задачей одного из этапов анализа генома человека является изучение условий функционирования (экспрессии) каждого гена, то есть характеристика каждого из возможных транскриптов в каждой из тканей на каждой из стадий развития в определенных условиях. Весь набор транскриптов организма называется транскриптомом а данный раздел науки получил название функциональная геномика или транскриптомика.  Создана база данных по сиквенсам 2,5 миллионов молекул кДНК (такие сиквенсы называют EST – Expression Sequence Tag), что на два порядка больше числа генов. Эти кДНК получены из 8 тысяч разных клонотек, полученых из разных тканей и в разных условиях. Однако собрать из всех EST полный транскриптом пока невозможно, поскольку в полученных кДНК неравномерно представлены разные участки мРНК (в основном 3′Gконцы) и в реконструируемых зрелых мРНК оказывается много брешей. Наибольшее разнообразие генных транскриптов экспериментальными методами выявлено в тканях мозга. Однако пока невозможно предсказать, какие из возможных для данного гена альтернативных форм зрелых мРНК реально синтезируются в клетках. В настоящее время созданы биологические чипы, в которых каждый экзон (все 442 тысячи) представлен олигонуклеотидом. Гибридизуя с такими чипами мРНК из различных тканей, можно установить, какие именно экзоны в них экспрессируются. Это позволяет экспериментально подтвердить существование гена и наличие его транскрипции в данных условиях в том или ином типе ткани. Изучение структуры и функций генов проводится в ряде проектов, поддержанных РФФИ. Наиболее интересными среди работ в этой области являются исследования Абелева Г.И. «Альтернативная экспрессия белка клеточного стресса и альфаGфетопротеина – молекулярногенетический анализ» (99G04G49068) и Рубцова П.М. «Структура и регуляция экспрессии гена рецептора гормона роста человека на уровне транскрипции и сплайсинга» (00G04G49041). В этих работах используются традиционные подходы, связанные с исследованием отдельных генов. В ближайшем будущем представляется перспективным переход к изучению генных ансамблей, для чего потребуется использование экспрессионных биочипов – основы новой функциональной геномики. Во многих лабораториях мира активно используются технологии биочипов при изучении координации работы генов у разных объектов, в том числе и человека. Можноожидать и перехода от упрощенных представлений анализа метаболических путей к новой идеологии в исследовании экспрессии геномов – концепции генных сетей, разрабатываемой новосибирскими учеными под рук. Н.
Читайте также: Геномика после 2000 г Геномика и генетика - генетическое будущее человечества |
|
| Последнее обновление ( 06.04.2009 г. ) |
| « Пред. | След. » |
|---|